Yvonne Zonderop is een pionier in het betrekken van burgers en andere ‘buitenstaanders’ bij journalistieke projecten. Zij stond aan de wieg van De Agenda, een vernieuwend project waarin wetenschappers en lezers van de Volkskrant samen problemen benoemen en oplossingen zoeken voor maatschappelijke thema’s, met behulp van onafhankelijke journalisten. Er verschenen tot nu toe vier Agenda’s – een vijfde is in voorbereiding, alle onder haar projectleiding.

2005 - 2006: De Sociale Agenda
2006 - 2007: De Ruimtelijke Agenda
2008 - 2009: De Economische Agenda
2009 - 2010: De Onderwijsagenda

In de zomer 2010 start Yvonne Zonderop een journalistiek onderzoeksproject voor De Groene Amsterdammer naar houdbare verbindingen tussen de bovenlaag en de onderlaag in onze samenleving.
Eerder ontwikkelde zij voor de RVU en de Volkskrant het project ‘de betere burger’, over het belang van burgerschap in de opvoeding en op de werkvloer.